4-8 сентября Очно

VIII ШКОЛА

ПО ПОЧВЕННОЙ

ЗООЛОГИИ И ЭКОЛОГИИ

ДЛЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ Регистрация

Стоимость

5 тыс. руб.

Место проведения

Тюмень, ул. Ленина, 25

Результат

получение уникальных навыков и знаний
+ сертификат

Полевой выезд в 1 день

озеро Кучак (50 км от Тюмени)

Почвенная зоология –
комплексная дисциплина, объединяющая разные науки и методы

Успешная научная карьера почвенного зоолога подразумевает не только прочные фундаментальные и специальные знания, но и умение ориентироваться в смежных дисциплинах и способность осваивать новые методы. Одним из стремительно развивающихся научных направлений стало ДНК баркодирование и, в последнее время, метабаркодирование, т.е. масштабное секвенирование ДНК маркеров в больших выборках организмов и целых сообществ. Применение ДНК метабаркодирования дает ключ к решению многих вопросов биологии, в том числе почвенной зоологии.

Используя простейших и жуков-стафилинид в качестве модельных групп, мы попытаемся изучить фауну экспериментального биотопа в окрестностях Тюмени при помощи метабаркодирования.

Информационное письмо 1

Информационное письмо 2

Что ждет?

Участникам Школы будут предложены общие лекции, мастер-классы и консультационная помощь по трем главным темам:

генетические технологии и ДНК метабаркодирование на службе почвенной зоологии, теория и практика

разнообразие и метабаркодирование почвенных простейших

интегративная систематика и метабаркодирование жуков-стафилинид

  • Обучение в школе будет проходить в форме работы над общим проектом, по результатам которого мы надеемся подготовить совместную научную публикацию.
  • Для практических занятий на школе желательно с собой иметь ноутбук
  • Прошедшим обучение будут выданы сертификаты дополнительного образования Тюменского государственного университета по направлению «Регенеративное земледелие»

Программа школы

04.09.
понедельник
05.09.
вторник
06.09.
среда
07.09.
четверг
08.09.
пятница

8.00-9.00.

Регистрация.

9.00-10.30.

Сбор у автобусов и выезд на Кучак.

11.00 – 11.15.

А.В. Лисица - приветственное слово.

11.15 – 11.30.

А.В. Тиунов - приветственное слово.

11.30-11.45.

Кофе-брейк.

12.00-13.30.

М.А. Сальницкая, А.Ю. Солодовников, Д.В. Тихоненков и др.

Сбор материалов в окрестностях оз. Кучак

13.30-14.30.

Обед.

14.00-15.30.

Сбор у автобусов и выезд в Тюмень.

15.45-17.00.

Сортировка собранного в поле материала.

17.00-17.15.

Кофе брейк.

17.15-18.00.

Сортировка собранного в поле материала.

18.00-19.00.

Круглый стол по результатам дня, ответы на вопросы.

9.00-10.00.

лекция

Д.В. Тихоненков Биоразнообразие протистов, метабаркодинг, и современная макросистематика эукариот

10.00-11.00.

лекция

А.Ю. Солодовников Биоразнообразие жуков-стафилинид и их баркодирование: что, где, как, и главное зачем

11.00-11.15.

Кофе-брейк.

11.15-12.00.

лекция

Е.А. Герасимова. Методология метабаркодинга

12.00-13.00

лекция

М.А. Сальницкая & В.А. Кривошеева. Теоретические и практические основы лабораторных этапов получения баркодов

13.00-14.00.

Обед.

14.00-16.15.

практика в лаборатории

Д.В. Тихоненков, Е.А. Герасимова Выделение ДНК из почв

16.15-16.30.

Кофе-брейк.

16.30-18.30.

практика в лаборатории

М.А. Сальницкая, В.А. Кривошеева. Выделение ДНК из насекомых

18.30-19.00.

Круглый стол по результатам дня, ответы на вопросы.

9.00-10.00.

лекция

В.А. Кривошеева. ДНК-секвенирование от Сангера до NGS. Традиционные методы обработки ДНК-последовательностей

10.00-11.00.

лекция, подключение из Японии

Б.А. Кирюхин. Методология обработки результатов метабаркодингового высокопроизводительного секвенирования: OTU и ASV

11.00-11.20.

Кофе-брейк.

11.20-12.20.

практика в лаборатории

В.А. Кривошеева. Амплификация ДНК насекомых

12.20-13.00.

практика в лаборатории

Д.В. Тихоненков, Е.А. Герасимова. Амплификация почвенной ДНК

13.00-14.00.

Обед.

14.00-14.45.

лекция

(приглашенный лектор) Что такое биоинформатика и ее значение

14.45-15.45.

практика в лаборатории

В.А. Кривошеева, Д.В. Тихоненков, Е.А. Герасимова. Форез и очистка продукта

15.45-16.00

Кофе-брейк.

16.00-16.45.

практика в лаборатории, продолжение

В.А. Кривошеева, Д.В. Тихоненков, Е.А. Герасимова. Форез и очистка продукта

16.45-17.30.

лекция

(приглашенный лектор) Скрипты, облака, кластеры и терминалы - что полезно знать современному биологу

17.30-18.30.

лекция

А.Ю. Солодовников. Филогении в биологии: как и зачем?

18.00-19.00

Круглый стол по результатам дня, ответы на вопросы.

9.00-9.45.

лекция

М.А. Сальницкая. Обзор основных этапов и методов обработки и анализа  ДНК последовательностей с целью построения филогений и определения видовых границ

9.45-10.45.

практика

М.А. Сальницкая. Обработка молекулярных данных: установка программ и освоение методов

10.45-11.00.

Кофе-брейк.

11.00-12.00.

лекция

М.А. Сальницкая. Анализ ДНК последовательностей: методы, основанные на моделях эволюции (Maximum Likelihood и Bayseian Inference)

12.00-13.00.

практика

В.А. Кривошеева. Анализ ДНК последовательностей при помощи метода Maximum Likelihood

13.00-14.00.

Обед.

14.00-15.00.

практика, продолжение

В.А. Кривошеева. Анализ ДНК последовательностей при помощи метода Maximum Likelihood

15.00-16.00.

практика

М.А. Сальницкая. Анализ ДНК последовательностей при помощи метода Bayesian Inference

16.00-16.15.

Кофе-брейк.

16.15-17.20.

практика, продолжение

М.А. Сальницкая. Анализ ДНК последовательностей при помощи метода Bayesian Inference

16.15-18.00.

М.А. Сальницкая, В.А. Кривошеева. Обработка собственных данных, ответы на вопросы и работа над ошибками.

18.00-19.00.

Круглый стол по результатам дня, ответы на вопросы.

9.00-10.00.

лекция

А.Ю. Солодовников. Понятие и критерии вида в биологии

10.00-11.30.

теория

М.А. Сальницкая. Методы определения видовых границ на основе анализа последовательностей ДНК (p-distance, PTP, ABGD и GMYC)

11.30-11.45.

Кофе-брейк.

11.45-13.00.

практика

М.А. Сальницкая. Освоение методов p-distance, PTP и ABGD

13.00-14.00.

Обед.

14.00-15.30.

практика

М.А. Сальницкая. Освоение метода GMYC

15.30-16.30.

Заключительный круглый стол, обсуждение результатов и статьи. А.В. Толстиков. Презентация научного проекта по изучению почвенной биоты на карбоновых полигонах.

16.30-17.00.

Закрытие школы.

Назад
Вперед

Будет интересно! Успейте зарегистрироваться

Регистрация

Участники

Преподаватели, инструкторы школы

Толстиков
Андрей Викторович

к.б.н. (ТюмГУ)
председатель


Тиунов
Алексей Владимирович

чл.-корр. РАН (ИПЭЭ РАН)
сопредседатель


Сальницкая
Мария Алексеевна

к.б.н., (ТюмГУ)
секретарь


Тихоненков
Денис Викторович

д.б.н. (ТюмГУ, ИБВВ РАН)


Лисица
Андрей Валерьевич

д.б.н., академик РАН (ТюмГУ)


Солодовников
Алексей Юрьевич

к.б.н., (ТюмГУ), Копенгагенский Университет, Датский Музей Естественной Истории


Кривошеева
Валерия Александровна

аспирант (ТюмГУ)


Герасимова
Елена Анатольевна

к.б.н. (ТюмГУ)


Кирюхин
Богдан Александрович

аспирант (ТюмГУ)


Организационный комитет школы

Толстиков Андрей Викторович, к.б.н. (ТюмГУ) – председатель
Тиунов Алексей Владимирович, чл.-корр. РАН (ИПЭЭ РАН) – сопредседатель
Сальницкая Мария Алексеевна, к.б.н., (ТюмГУ) – секретарь
Созонова Полина Игоревна, (ТюмГУ) - технический секретарь
Лямцева Екатерина Владимировна, (ТюмГУ) - технический секретарь
Лисица Андрей Валерьевич, д.б.н., академик РАН (ТюмГУ)
Солодовников Алексей Юрьевич, к.б.н., (ТюмГУ, Копенгагенский Университет, Датский Музей Естественной Истории)
Тихоненков Денис Викторович, д.б.н. (ТюмГУ, ИБВВ РАН)
Кривошеева Валерия Александровна (ТюмГУ)

Контакты

Сальницкая Мария Алексеевнач

soil.zoology.2023@gmail.com
+79111458259


Школа проводится при финансовой поддержке Министерства науки и высшего образования Российской федерации в рамках Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019-2027 годы (соглашение №075-15-2021-1345, Уникальный идентификатор проекта RF----193021X0012).