12 декабря, в День российской Конституции, прошло торжественное награждение выпускников программы дополнительного профессионального образования «Экологическая метагеномика» для иностранных обучающихся. Среди выпускников – обучающиеся из Гвинеи, Мексики, Сальвадора и Чили.

Поздравив слушателей с получением удостоверений о повышении квалификации, первый проректор ТюмГУ Андрей Толстиков рассказал о возможностях проведения исследований в России по современным научным направлениям, включая генетические технологии, используемые в самых разных областях наук о жизни: медицине, ветеринарии и растениеводстве, а также в оценке состояния окружающей среды.

Курс был прочитан Антоном Свининым, доцентом Института экологической и сельскохозяйственной биологии (X-BIO) ТюмГУ и одновременно старшим научным сотрудником лаборатории стабильности хромосом и микроэволюции генома Института цитологии РАН в Санкт-Петербурге. Часть практических занятий была проведена заведующим молодежной лабораторией систематики и филогенетики насекомых Института X-BIO Марией Сальницкой. В ходе лекций и практических занятий студенты познакомились с ключевыми терминами и понятиями метагеномики, а также изучили методы и принципы работы с метагеномными данными. Слушатели получили уникальный опыт работы с метагеномными данными, используя современные методы компьютерной обработки результатов секвенирования нового поколения.

Анализируя ДНК микроорганизмов и работая с нуклеотидными последовательностями, полученными в результате секвенирования нового поколения, обучающиеся освоили базовые навыки работы на сервере и языках программирования bash, R и Python. Они изучили методы обработки сырых данных, включая тримминг и контроль качества, а также сборку метагеномов и аннотацию микробных сообществ. Научились искать таргетные гены в массиве геномных данных, включая метагеномы, собранные в ходе выполнения задач курса, применяя при этом новейшие программы с открытым исходным кодом. Важным аспектом обучения стало освоение методов визуализации результатов с помощью языка R.

Для участников программы был разработан веб-сайт, на котором можно найти полезную и актуальную информацию, связанную с лекциями, рекомендованной литературой и данными о научно-исследовательской работе автора курса. Такой веб-интерфейс обеспечил слушателей возможностями прохождения курса с использованием новейших методических приёмов.
Повышение квалификации иностранных граждан прошло как часть серии образовательных мероприятий выполняемого в университете проекта «Микробиомы агроценозов: масштабный скрининг, мониторинг и методы управлениями консорциями микроорганизмов для регенеративного земледелия» Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий в Российской Федерации (2019-2030 гг.).

Источник:

Управление стратегических коммуникаций ТюмГУ